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加强部门之间的协作配合的办法如下：

1、增强部门协调配合的意识，建立部门间协调配合制度，目的是加强部门间互相协调，形成工作合力；

2、加强部门间的联系与沟通，部门在处理问题时，如涉及其他部门职责范围内的事项，由主管领导牵头，主动征求有关部门的意见，认真协商，积极配合；

3、规范部门间协调配合管理，坚持一件事情原则上由一个部门负责，确需多个部门管理的事项，要明确牵头部门，分清主次责任。